Разположено е на 10 км южно от Самоков, на 12 км от Боровец, на 18 км от курорта Мальовица и на 70 км от София.

Селото се намира в северното подножие на Рила, край река Леви Искър.

Надморска височина - 1195 м.

До 1887 г. селото се е наричало Сръбско село заради някогашните заселници сръбски рудари и миньори, преселени от по-големите рудодобивни центрове в Сърбия по време на османското владичество.

Жителите на Мала Църква са 399 души.

Запазената и до днес църква „Св. Св. Петър и Павел“ от 16 в. е била вкопана в земята по време на османското владичество. Църквата е обявена за паметник на културата. Църквата "Рождество на Пресвета Богородица" е построена в парка над селото. Над селото и под гората се намира и параклиса "Св. Георги”.

Традиционният събор на селото е на Петровден – 29 юни. Провежда се и празник на водата в чест на най- водната българска планина – Рила.

По красива пътека се стига до местността Песако, където реката изчезва в земята и се появява чак след няколко стотин метра.

Препитанието на местното население доскоро е било свързано главно с животновъдството, отглеждане на картофи и дърводобив. Сега туризмът става все повече водещ отрасъл. В курортното село има семейни хотели, уютни къщи за гости, ресторанти.